TEDMED 2017
Dan Knights: How we study the microbes living in your gut
ダン・ナイツ: 腸内細菌はこんな方法で研究されている
Filmed:
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ヒトの腸内には約百兆の細菌が住んでおり、感染を予防し、消化を助け、免疫系を調整してくれています。しかし、ヒトの体が現代社会に適応するとともに常在細菌の種類が減ってきており、同時に腸内細菌多様性の減少に関連する病気が先進国で急激に増加しています。計算微生物学者のダン・ナイツが、発展途上国の住民とアメリカ人のマイクロバイオームの違い、そしてそれが健康に及ぼしうる影響についての興味深い発見を紹介します。あなたの体内に広がる細菌の世界について、そして腸内細菌の多様性を取り戻し補充する技術を開発するためにどんな研究がされているのか、見ていきましょう。
Dan Knights - Computational microbiologist
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
Dan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease. Full bio
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00:12
If I asked you to name a microbe
that's living in your gut,
that's living in your gut,
0
787
5514
腸内に住んでいる
細菌の名前を聞いてみると
細菌の名前を聞いてみると
00:18
many of you would probably say E. coli.
1
6325
3351
ほとんどの方が
大腸菌と答えるでしょう
大腸菌と答えるでしょう
00:21
A lot of people say this.
It's the best-known of the gut microbes.
It's the best-known of the gut microbes.
2
9700
3765
そのとおり 大腸菌は
一番 有名な腸内細菌ですね
一番 有名な腸内細菌ですね
00:25
But it turns out that E. coli
is outnumbered in your gut
is outnumbered in your gut
3
13489
4505
しかし 腸内の大腸菌は
他の種類の細菌の千分の１ほどしか
他の種類の細菌の千分の１ほどしか
いないことが判明しました
00:30
about a thousand to one
4
18018
2093
そのうち多くは みなさん
おそらく聞き覚えがない細菌で
おそらく聞き覚えがない細菌で
00:32
by other species, many of which
you probably haven't heard of.
you probably haven't heard of.
5
20135
2991
00:35
These are Bacteroides;
Prevotella is another example.
Prevotella is another example.
6
23150
4581
例えばバクテロイデスとか
プレボテラといった菌です
プレボテラといった菌です
00:39
Those are the two that dominate
the modern human gut.
the modern human gut.
7
27755
3468
この２種類が現代人の
腸内細菌の中では圧倒的に多いのです
腸内細菌の中では圧倒的に多いのです
00:43
There are about a hundred trillion
microbes living inside you.
microbes living inside you.
8
31247
4849
みなさんの体内には
百兆の細菌が住んでいます
百兆の細菌が住んでいます
00:49
We call this your microbiome,
9
37090
3271
これを「マイクロバイオーム」と
呼んでいます
呼んでいます
00:52
so it's like a little world
living inside you --
living inside you --
10
40385
2244
あなたの体内に住んでいる
小さな世界というか
小さな世界というか
00:54
actually more like a universe.
11
42653
1874
宇宙に近いです
00:56
A hundred trillion means
if you took a blade of grass
if you took a blade of grass
12
44896
3454
百兆個というのは
もしも 腸内細菌１つにつき
もしも 腸内細菌１つにつき
01:00
and planted it for every microbe
living in your gut,
living in your gut,
13
48374
3125
芝生を１本ずつ植えたら
01:03
that could fill a million football fields.
14
51523
2354
100万のアメフト場を
覆うほどの数です
覆うほどの数です
01:05
So it's incredibly complex.
15
53901
1746
信じられないほど複雑です
01:07
But interestingly,
16
55671
1816
でも 興味深いことに
01:09
as our bodies have been adapting
to life in modern society,
to life in modern society,
17
57511
4433
私たちの体は
現代社会の生活に適応するにつれ
現代社会の生活に適応するにつれ
01:13
we're losing some of our normal microbes,
18
61968
4104
正常な腸内細菌の一部を
失いつつあり
失いつつあり
01:18
and at the same time,
19
66096
2925
それと同時に
かなりの種類の
腸に関する病気が
腸に関する病気が
01:21
there are quite a few diseases
related to the gut
related to the gut
20
69045
3355
01:24
that are skyrocketing
in developed nations all around the world.
in developed nations all around the world.
21
72424
5429
世界中の先進国で
急増しています
急増しています
01:29
And many of you probably know
someone who suffers from obesity,
someone who suffers from obesity,
22
77877
4659
みなさんの知り合いにも
肥満や 糖尿病や クローン病や
肥満や 糖尿病や クローン病や
01:34
diabetes, Crohn's disease
or ulcerative colitis,
or ulcerative colitis,
23
82560
3961
潰瘍性大腸炎や
アレルギーや 喘息で
アレルギーや 喘息で
01:38
allergies and asthma.
24
86545
1895
苦しんでいる人がいるでしょう
01:40
Every one of these diseases
25
88464
1365
それらすべての病気と
01:41
and many others related to metabolism
and autoimmunity
and autoimmunity
26
89853
4247
多くの代謝性疾患と自己免疫疾患は
01:46
are linked to a loss
of healthy diversity in the gut.
of healthy diversity in the gut.
27
94124
5119
健康な腸内細菌の多様性が
失われたことに関連しています
失われたことに関連しています
01:52
My lab got our first indication of this
28
100081
2191
私の研究室では
この兆候を初めて観察したとき
この兆候を初めて観察したとき
01:54
when actually we were studying
non-human primates.
non-human primates.
29
102296
3770
実はヒトではない霊長類を
研究していました
研究していました
01:58
We wanted to find out what happens
to a monkey's microbiome
to a monkey's microbiome
30
106090
5131
ジャングルから動物園へ
移されたサルのマイクロバイオームが
移されたサルのマイクロバイオームが
02:03
when they move from the jungle to a zoo.
31
111245
4039
どうなるかを調査していたのです
02:08
Does their microbiome change?
Do they pick up new bugs?
Do they pick up new bugs?
32
116166
2572
マイクロバイオームの変化は？
新たな細菌の定着は？
新たな細菌の定着は？
02:10
Do they lose some?
Does it get better or worse?
Does it get better or worse?
33
118762
2741
減った細菌はいるか？
それで体調はよくなるか？悪化するか？
それで体調はよくなるか？悪化するか？
02:13
We tracked two different
species in the jungle,
species in the jungle,
34
121527
3514
ジャングルに生息する
２種類のサルを追跡しました
２種類のサルを追跡しました
02:17
one in Vietnam, one in Costa Rica,
35
125065
3610
ベトナムのサルと
コスタリカのサルです
コスタリカのサルです
02:20
and then we sequenced
the DNA from their stool.
the DNA from their stool.
36
128699
2881
そして それぞれフンから
DNA配列を検出しました
DNA配列を検出しました
02:23
This is how we study the microbiome
in my research lab.
in my research lab.
37
131604
3541
私の研究室ではこうやって
マイクロバイオームを研究しています
マイクロバイオームを研究しています
02:27
And what we found in the DNA
is that in the wild,
is that in the wild,
38
135169
4112
そのDNA配列から分かったことは
野生状態では
野生状態では
02:31
these two species had
totally different sets of microbes.
totally different sets of microbes.
39
139305
3961
２種類の間で腸内細菌の構成が
全く異なっていて
全く異なっていて
02:35
It was like a fingerprint for the species.
40
143290
2612
まるで その種の特徴が
現われているかのようでした
現われているかのようでした
02:37
But in the zoo, they had lost
most of that diversity
most of that diversity
41
145926
5165
しかし 動物園に移された後は
細菌の多様性をほとんど失い
細菌の多様性をほとんど失い
02:43
and had acquired
some other set of microbes.
some other set of microbes.
42
151115
2531
新たな組み合わせの細菌が
定着していました
定着していました
02:46
So this was very curious.
43
154379
3348
とても不思議でした
マイクロバイオームは２種類ありました
02:49
We've got these two different microbiomes.
44
157751
2009
02:51
In the wild, picture a lush
tropical rainforest
tropical rainforest
45
159784
4158
野生のサルの場合は
緑豊かな熱帯雨林のようでした
02:55
living the guts of these monkeys.
46
163966
2469
これが ここでいう「多様性」です
02:58
That's the kind of diversity
that we're talking about.
that we're talking about.
47
166459
2540
そして 動物園のサルは
多様性を失っていました
多様性を失っていました
03:01
Then in the zoo, they've lost diversity.
48
169023
2626
03:04
Picture a rainforest
that's been burned to the ground
that's been burned to the ground
49
172298
3572
焼け野原になった熱帯雨林が
03:07
and taken over by a few invasive species.
50
175894
2340
一握りの外来種に
支配されている —
支配されている —
03:11
That's more like the microbiome
in a captive primate.
in a captive primate.
51
179105
3801
檻の中の霊長類のマイクロバイオームは
そんな状態なのです
そんな状態なのです
03:15
Now, in the meantime,
52
183955
1237
さて それと同時に
03:17
many of the animals in the zoo
are not doing so well.
are not doing so well.
53
185216
2627
動物園の動物の多くは
元気がありません
元気がありません
03:19
They have issues with obesity,
54
187867
2906
肥満だったり
03:22
wasting,
55
190797
1336
衰弱していたり
03:24
gastroenteritis, diarrhea, bloating,
56
192157
3049
胃腸炎に 下痢に 腹部膨満
03:27
and some of them were barely
holding onto their lives.
holding onto their lives.
57
195230
2809
瀕死の動物も数頭いました
03:31
Now, of course, we were
very interested to find out
very interested to find out
58
199073
3588
さて もちろん 私たちが
非常に関心を持っていたのは
非常に関心を持っていたのは
03:34
what are these so-called invasive species
that are taking over in the zoo.
that are taking over in the zoo.
59
202685
4354
動物園を制圧しつつある このいわゆる
外来種の腸内細菌とは何者なのか？でした
外来種の腸内細菌とは何者なのか？でした
03:39
So we went back to the DNA,
and what the DNA told us
and what the DNA told us
60
207899
2889
そこで DNAをもう１度検査したところ
03:42
is that every monkey in the zoo
61
210812
4503
動物園のサル全頭の体内には
03:47
had become dominated
by Bacteroides and Prevotella,
by Bacteroides and Prevotella,
62
215339
5168
バクテロイデスとプレボテラが
圧倒的に多いことが判明しました
圧倒的に多いことが判明しました
03:52
the same microbes that we all have
in our guts as modern humans.
in our guts as modern humans.
63
220531
4381
これは 現代人の腸内にある
腸内細菌と同じです
腸内細菌と同じです
03:59
We wanted to find a way to visualize this,
64
227050
2893
それを視覚化したかったので
04:01
and we used some tools
from multivariate ecology
from multivariate ecology
65
229967
3940
生態学の多変量解析ツールを使い
04:05
to put all of the microbiomes
we were studying onto an axis.
we were studying onto an axis.
66
233931
4412
研究中のマイクロバイオームを全て
xy軸に配置しました
xy軸に配置しました
04:10
And what you're seeing here
is a distance plot
is a distance plot
67
238367
4070
こちらが その距離を
示したプロット図です
示したプロット図です
04:14
where every point
is a different animal's microbiome.
is a different animal's microbiome.
68
242461
4905
図上の点は動物個体ごとの
マイクロバイオームです
マイクロバイオームです
04:19
So every point represents
a whole zoo of microbes.
a whole zoo of microbes.
69
247390
2793
点の１つ１つが
微生物でできた宇宙のようなものです
微生物でできた宇宙のようなものです
04:23
And the microbiomes
that have a lot of microbes in common
that have a lot of microbes in common
70
251207
3856
マイクロバイオーム同士
共通した細菌が多いほど
共通した細菌が多いほど
04:27
are close to each other.
71
255087
1413
近い位置にあります
04:28
The ones that are very different
are farther apart.
are farther apart.
72
256524
2448
異なる細菌を持つほど
遠く離れています
遠く離れています
04:30
So this is showing you
73
258996
1517
この図から
04:32
that the two groups of wild monkeys
are over on the left.
are over on the left.
74
260537
5698
野生のサル２種類は
左側にまとまっていることがわかります
左側にまとまっていることがわかります
04:38
The top left are these
highly endangered monkeys
highly endangered monkeys
75
266259
3772
左上はベトナムにいる
絶滅危惧種の
絶滅危惧種の
04:42
called the red-shanked douc in Vietnam.
76
270055
2973
アカアシドゥクラングールという
（野生の）サルです
（野生の）サルです
04:45
And at the bottom left
are monkeys from Costa Rica.
are monkeys from Costa Rica.
77
273052
3631
左下はコスタリカの（野生の）サルです
04:49
So you can see that they have
totally different microbiomes in the wild.
totally different microbiomes in the wild.
78
277481
3444
野生では全然違う
マイクロバイオームだとわかりますね
マイクロバイオームだとわかりますね
04:52
And then the same two species
of monkey in the zoo are converging,
of monkey in the zoo are converging,
79
280949
5397
このサル２種が 動物園に収容されると
どちらも図中で同じ場所に集まってきます
どちらも図中で同じ場所に集まってきます
04:58
so their microbiomes change
80
286370
1882
つまり マイクロバイオームが変化して
05:00
and they become
much more similar to each other,
much more similar to each other,
81
288276
3220
お互いに似通ってくるということです
05:03
even though these are zoos
on different continents,
on different continents,
82
291520
2673
他の大陸にある動物園だろうと
05:06
different geographical regions,
and they're eating different diets.
and they're eating different diets.
83
294217
3342
地理的に異なる場所だろうと
食べ物が異なろうと そうなります
食べ物が異なろうと そうなります
05:09
Now, we did study
some other species of primate.
some other species of primate.
84
297583
3161
私たちは他の種類の
霊長類も研究しました
霊長類も研究しました
05:12
What species of primate
do you think is even more divergent
do you think is even more divergent
85
300768
5739
檻に入ってる霊長類よりも
さらに 野生の霊長類から
さらに 野生の霊長類から
かけ離れている霊長類は
何だと思いますか？
何だと思いますか？
05:18
from the wild primates
than the captive primates?
than the captive primates?
86
306531
3666
05:24
Modern humans.
87
312665
1429
現代人です
05:27
These are humans
living in developing nations.
living in developing nations.
88
315049
3483
これは発展途上国にいる
ヒトのものです
ヒトのものです
05:30
So they were more different
from the wild primates
from the wild primates
89
318556
3143
動物園のサルよりさらに
05:33
than those in the zoo.
90
321723
1921
野生のサルから離れています
05:35
And the final group that we studied,
all the way on the right,
all the way on the right,
91
323668
5381
そして 最後に研究したのが
一番 右側の集団で
一番 右側の集団で
05:41
is people living in the USA.
92
329073
1944
アメリカに住むヒトです
05:44
And when I saw this figure,
93
332033
2848
この図を見たとき
05:46
the hairs raised up
on the back of my neck,
on the back of my neck,
94
334905
3101
背筋がゾッとしました
05:50
because one way to think about it is,
"Oh, that's interesting,
"Oh, that's interesting,
95
338030
3087
こういう捉え方もあるからです
「興味深いね
「興味深いね
05:53
captive monkeys are sort of on their way
to becoming like Americans."
to becoming like Americans."
96
341141
3944
檻の中のサルは ある意味
アメリカ人へ進化途中なんだ」
アメリカ人へ進化途中なんだ」
05:57
(Laughter)
97
345109
1087
（笑）
05:58
But the other way to think about it
98
346220
2396
しかし 別の捉え方もあります
06:00
is that Americans
are like super-captive monkeys.
are like super-captive monkeys.
99
348640
3349
「アメリカ人は大規模な檻に
入れられたサルだ」
入れられたサルだ」
06:04
And I was actually looking
at this figure on my computer screen
at this figure on my computer screen
100
352671
4698
実は この図をコンピューターで
見ていた時に
見ていた時に
06:09
when I got the news
that four of the red-shanked doucs
that four of the red-shanked doucs
101
357393
4928
動物園にいる
アカアシドゥクラングールが４匹
アカアシドゥクラングールが４匹
06:14
had died in the zoo of gut-related issues.
102
362345
3104
腸の病気で死んだというニュースが
飛び込んできました
飛び込んできました
06:17
So for some of these animals,
103
365473
1968
ある種類の動物にとって
06:19
having the right microbes
living inside them
living inside them
104
367465
2698
適切な細菌が腸内にいるかどうかが
06:22
may be a matter of survival.
105
370187
1970
生死を分けるのかもしれません
06:24
Now this brings us
to the human part of the story.
to the human part of the story.
106
372181
3507
では これを人間に当てはめてみましょう
06:27
Obviously, the microbiomes in the USA
107
375712
3215
アメリカ人の場合 もちろん
マイクロバイオームが
マイクロバイオームが
06:30
aren't causing premature death
as frequently as in the zoo,
as frequently as in the zoo,
108
378951
5501
動物園ほど頻繁に 早死にの原因に
なっているわけではありませんが
なっているわけではありませんが
06:36
but we have major risk
of obesity, diabetes,
of obesity, diabetes,
109
384476
4374
アメリカ人は 肥満や糖尿病を
はじめとする様々な疾病の
はじめとする様々な疾病の
06:40
a number of these other diseases.
110
388874
1897
リスクを抱えています
06:43
And this applies not just to people
who have been living in the USA
who have been living in the USA
111
391133
4420
これはアメリカに
数世代に渡って住んでいる人にだけ
数世代に渡って住んでいる人にだけ
06:47
for many generations,
112
395577
1984
当てはまることではありません
06:49
but also to immigrants and refugees,
113
397585
2436
移民や難民にも言えることです
06:52
who, for most immigrant
and refugee groups,
and refugee groups,
114
400045
3682
移民と難民のほとんどは
06:55
arrive in the USA metabolically healthy,
115
403751
3101
アメリカ到着時は
代謝疾患を患っていないのに
代謝疾患を患っていないのに
06:58
and then within a few years,
116
406876
1380
それから数年以内に
07:00
they become just as high-risk
for obesity and diabetes
for obesity and diabetes
117
408280
3358
他のアメリカ人と同様に
肥満と糖尿病の
肥満と糖尿病の
07:03
as other Americans.
118
411662
2081
ハイリスク群になるのです
07:05
And we discussed
this issue with two groups
this issue with two groups
119
413767
3698
この問題を
東南アジアからアメリカへの移住が続いている
２つの民族グループと共に話し合いました
２つの民族グループと共に話し合いました
07:09
that have been coming to the USA
from Southeast Asia:
from Southeast Asia:
120
417489
2547
07:12
the Hmong, who started coming
in the mid-1970s
in the mid-1970s
121
420060
4194
1970年代中盤に
ベトナム戦争とラオス内戦から逃れ
ベトナム戦争とラオス内戦から逃れ
07:16
as refugees from the Vietnam War
and the US secret war in Laos;
and the US secret war in Laos;
122
424278
5500
難民として渡ってきたモン族と
07:21
and the Karen, who have been coming
more recently as refugees from Myanmar.
more recently as refugees from Myanmar.
123
429802
4912
より最近 ミャンマーからの難民として
移住が始まったカレン族です
移住が始まったカレン族です
07:26
So we've been working for a few years
124
434738
1778
私たちは モン族とカレン族の
マイクロバイオームが
マイクロバイオームが
07:28
with these local
communities and clinicians
communities and clinicians
125
436540
2541
07:31
to study what happens
to the Hmong and Karen microbiomes
to the Hmong and Karen microbiomes
126
439105
5417
タイの村や難民キャンプから
アメリカに移住した後
アメリカに移住した後
どう変化するのかを研究するために
07:36
when people move from refugee camps
and villages in Thailand to the USA.
and villages in Thailand to the USA.
127
444546
6996
地域コミュニティや医療者たちと
数年間 活動してきました
数年間 活動してきました
07:44
And what we found
128
452314
1564
そこで発見したのは
07:45
is that when people
come to the USA from these groups,
come to the USA from these groups,
129
453902
5711
その民族の人たちが
アメリカに来ると
アメリカに来ると
かなりの割合のマイクロバイオームを
失うということです
失うということです
07:51
they lose a large fraction
of their microbiome,
of their microbiome,
130
459637
3396
20％ほど失うのです
07:56
somewhere around 20 percent,
131
464343
1777
07:58
and those who come to the USA
and become obese
and become obese
132
466144
4269
アメリカに来てから肥満になった人は
08:02
lose about a third of their microbes.
133
470437
1953
腸内細菌が３分の１ほど減ります
08:06
So we know that moving to the USA
134
474905
1952
だから アメリカに引っ越すだけで
08:08
is sufficient to cause
a dramatic change in your microbiome,
a dramatic change in your microbiome,
135
476881
3993
腸内細菌に劇的な変化が起きるのです
08:12
probably not for the better.
136
480898
1769
多分 悪い方にです
08:15
Are these microbes
actually causing the obesity,
actually causing the obesity,
137
483571
4858
その細菌が肥満の原因なのか？
08:20
or is the obesity causing
a change in the microbes?
a change in the microbes?
138
488453
3460
それとも 肥満が細菌の割合を変えるのか？
08:23
This is something
that we're following up on,
that we're following up on,
139
491937
2143
それは今 追跡調査しているところです
08:26
and the evidence we have now in my lab
140
494104
3642
そして 現在 私の研究室で
つかんでいるエビデンスを
つかんでいるエビデンスを
08:29
combined with evidence
from a number of labs around the world
from a number of labs around the world
141
497770
3110
世界中の研究室のエビデンスと合わせると
08:32
tells us that certain changes
in the microbiome
in the microbiome
142
500904
3072
マイクロバイオームの変化の
種類によっては
種類によっては
08:36
do lead to obesity,
143
504000
2509
肥満など 多くの
いわゆる現代の西洋化した病気に
いわゆる現代の西洋化した病気に
08:38
and a number of other modern,
kind of Westernized diseases.
kind of Westernized diseases.
144
506533
3451
つながっていることがわかりました
08:43
The good news is that
your microbiome can actually change.
your microbiome can actually change.
145
511353
5309
嬉しいことに 実は あなたの
マイクロバイオームは変えられます
マイクロバイオームは変えられます
08:48
Unlike your own genome,
146
516686
2523
ゲノムとは違い
08:51
it's a living, breathing thing,
147
519233
2349
生き物だからです
08:53
and there's a broad front
of research happening right now
of research happening right now
148
521606
3531
そして マイクロバイオーム環境が
悪化しても
悪化しても
08:57
to better understand
how we can restore our microbiomes
how we can restore our microbiomes
149
525161
3794
それを修復する方法の解明が
今 現在 幅広く
今 現在 幅広く
09:00
when something goes wrong,
150
528979
1603
研究されています
09:02
using diet,
151
530606
1627
食事や
09:04
using live microbes.
152
532257
2658
生きた細菌を使った方法です
09:06
And in fact, one of the next steps for us
153
534939
2800
そして 私たちの次のステップは
09:09
is collecting and preserving microbes
from healthy people around the world
from healthy people around the world
154
537763
4588
世界中の健康な人たちから
細菌を集めて保存することです
細菌を集めて保存することです
09:14
so that they can be kept
as cultural assets for those groups
as cultural assets for those groups
155
542375
5555
そうすれば その細菌がその民族の
文化財として保存され
文化財として保存され
09:19
to potentially protect them
as they adapt to modern society,
as they adapt to modern society,
156
547954
4841
現代社会に適応する際に彼らを
守れるかもしれませんし
守れるかもしれませんし
09:24
and to protect future generations
157
552819
2454
関連疾患リスクが
09:27
who are currently growing up
to have increased risk of these diseases
to have increased risk of these diseases
158
555297
4199
世代ごとに増加していく環境で
現在育っている
現在育っている
09:31
with every generation.
159
559520
1488
未来の世代も守れます
09:33
I'm looking forward to a future
160
561714
2602
マイクロバイオームを
修復し 補充するのに
修復し 補充するのに
09:36
where we have the tools that we need
to restore and replenish our microbiomes,
to restore and replenish our microbiomes,
161
564340
6722
必要な技術を手にできる
将来を楽しみにしています
将来を楽しみにしています
09:43
and in that world, the monkeys
will live happier and healthier lives,
will live happier and healthier lives,
162
571562
5269
その世界では サルたちは
もっと幸せに健康に生きるし
もっと幸せに健康に生きるし
人間もそうなります
09:48
and so will we.
163
576855
1421
09:51
(Applause)
164
579831
3676
（拍手）
ABOUT THE SPEAKER
Dan Knights - Computational microbiologistDan Knights develops computational methods for doing precision medicine with gut bacterial communities, or microbiomes, and he applies those methods to study human disease.
Why you should listen
Trillions of bacteria live in our guts, protecting us from infection and aiding our digestion, yet these communities are so complex that we need advanced computational methods to study them. In his multidisciplinary research lab, Dan Knights combines expertise in data mining and biology to learn about how modern lifestyles and medical practices are affecting our microbiomes and leading to increases in modern diseases.
Knights received his PhD in computer science from the University of Colorado, followed by a post-doctoral fellowship at Harvard Medical School. He has co-authored more than 70 highly cited articles in top multidisciplinary journals. In 2015 he was named a McKnight Land-Grant Professor by the University of Minnesota. His lab is building a next-generation informatics pipeline for microbiome-targeted drug discovery, linking nutrition and microbial activity to clinical outcomes.
Dan Knights | Speaker | TED.com